El vocalista Brandon Boyd y el baterista José Pasillas fueron compañeros de escuela. En 1990, cuando se encontraban en 8vo. grado en la escuela A.E. Wright, José conoció al guitarrista Mike Einziger. la dupla hizo amistad con el bajista Alex Katunich, quien fue explusado de una banda de jazz por no saber leer las partituras. Al comienzo tocaban covers de Metallica y Megadeth, en los cuales José tenía poco interés. Estos covers les ayudaron a ganar una pequeña reputación y convertirse en la atracción musical del barrio.
Su primera canción, "Love Sick", tenía un sonido semi-Incubus pero con algo de funk y trash. Otras canciones escritas en este tiempo fueron : "Purple Kool-Aid", "Sylvester Polyester", "My Soul (The Underground)", y "The Milkman Song". Para entonces, el grupo no contaba con nombre y debían escoger uno de una vez. Brandon sugirió que sea un nombre raro como 'Spiral Staircase' o 'Chimera', luego Alex sugirió 'Chunk-O-Funk'. Pero Mike trajo un diccionario, encontró la palabra 'Incubus',
Incubus había estado grabando sus demos , el 7 de enero de 1995, la banda lanzó el demo "Incubus". Unos diez meses más tarde, luego de grabar con Jim Wirt en Santa Mónica, California, Incubus lanzó su primera producción bajo el sello independiente "Stopuglynailfungus Music on Chillum". El lanzamiento fue el 1° de noviembre de 1995 y se llamó "Fungus Amongus".
El 29 de julio de 1997 fue lanzado este disco, que incluía la canción "Familiar" en la cual Incubus compartía roles con DJ Greyboy.
Luego de estar en gira, la banda lanzó "S.C.I.E.N.C.E" el 9 de septiembre de 1997 y se encaminó a promocionarlo.
Al terminar sus giras y después de un arduo trabajo, se tomaron un tiempo para producir su nuevo disco. Así, el 26 de octubre de 1999 lanzaron "Make Yourself". El segundo single del "Make Yourself" fue "Stellar", que también tuvo una gran acogida,
El 5 de octubre del 2000, Make Yourself se volvió Disco de Platino.
Dada la gran demanda de los fanáticos por su primera producción "Fungus Amungus", la cual era casi imposible de conseguir, la banda decidió relanzar este disco el 7 de noviembre del 2000.
Comenzando el 2001, el grupo lanzó el 15 de enero, el tercer sencillo del "Make Yourself", titulado 'Drive'. En Julio, "Make Yourself" se volvió Doble Platino
lanzó el 21 de agosto del 2001, el single "Wish you were here" incluído en su nueva producción "Morning View".
El 23 de octubre del 2001, Incubus lanzó su 4to. disco titulado "Morning View",
2004 lanzan el disco A crow left of the murder
2006 lanzan Ligths Granades